胚胎停止发育后，如果是在孕早期出现的供卵试管合法机构这种情况，通常情况下胚芽是有可能会缩短的。但如果是在孕晚期时，则可能不会导致胚芽变短。

1.可能会：在怀孕期间，由于受到外界因素的影响或者母体本身存在疾病等，均有可能会导致胚胎停止发育的情况发生。若是在孕早期发现后，并且没有及时进行处理，就有可能会导致胚胎组织坏死，从而引起机体内的激素水平发生变化，造成子宫内膜剥脱异常，所以会出现胚芽逐渐缩短的现象。此时建议患者需要及时到医院就诊，在医生指导下通过清宫术的方式进行治疗。

2.可能不会：但若是胚胎停止发育的时间比较晚，而且已经过了保胎的时期，其停止发育之后并不会影响到胚芽的生长和发育，因此也不会导致胚芽变短。同时还会表现为停经时间延长、阴道流血等症状。此时则不需要过于担心，可以在医生指导下使用米非司酮片、米索前列醇片等药物进行流产。

此外，在日常生活中要注意个人卫生，勤换洗内裤，以免引发感染的情况。若期间出现其他不适症状，还需及时就医诊治，以免延误病情。